Ce cours présente le traitement informatique des images microscopiques confocales acquises in vivo et in situ par une mini-sonde flexible. Après les prétraitements qui permettent de corriger et quantifier l’image, le cours se focalise sur deux problèmes clefs : la construction automatique de mosaïques d’images pour augmenter le champ de vue tout en préservant voire en augmentant la résolution microscopique, puis la projection d’informations sémantiques en rapprochant automatiquement toute nouvelle image de celles déjà expertisées dans un atlas intelligent. Le cours décrit notamment des algorithmes permettant de construire des représentations des images invariantes par certaines transformations et des algorithmes permettant de retrouver des images similaires dans une grande base d’images.
Ce cours est complété par les deux séminaires suivants :
– « Les enjeux médicaux de l’endomicroscopie », Jean-Paul Galmiche (CHU de Nantes) ;
– « Des étoiles aux cellules, de la recherche à l’entreprise », Sacha Loiseau (Mauna Kea Technologies, Paris).
