Résumé
Approches (passées et récentes) de détection de telles séquences enhancers. Pièges à enhancers et méthodes de criblage à haut débit. Quelques exemples, en particulier de l’analyse dynamique d’une trajectoire de régulation.
Dans cette deuxième leçon, après un bref rappel de quelques définitions, des méthodes sont présentées qui permettent d’identifier des « enhancers » sans introduire de biais particulier au départ. Ces méthodes dérivent toutes de l’approche par « piège à enhancers », dans des versions actualisées par les développements technologiques récents (STARR-seq). Quelques avantages et inconvénients de ces approches sont discutés.
Ensuite, les systèmes de détection de l’activité « enhancer » utilisés actuellement chez les mammifères sont décrits, de la production de souris transgéniques par simple injection, à des systèmes d’agrégations de cellules ES qui permettent des analyses plus rapides. L’utilisation de la capacité des cellules ES à être réintroduites dans des embryons, voire même à les former entièrement, est ensuite discutée à l’aide de quelques exemples récents.
