Dans le cadre du Consortium LIPID MAPS, notre laboratoire a développé une approche rigoureuse et globale permettant l’analyse lipidomique de centaines d’acides gras, d’acyléthanolamines et d’eicosanoïdes inflammatoires, y compris de leurs nombreux métabolites résultant de réactions d’un ensemble de cyclooxygénases, de lipoxygénases, de cytochromes P450 et d’oxydation non-enzymatique produisant des isoprostanes simples mais aussi combinés.
Cette analyse lipidomique nous a permis de caractériser la signalisation lipidique cellulaire des récepteurs de type Toll (Toll-like receptors, TLR) et purinèrgiques, ainsi que leur « synergie » dans des macrophages activés par des endotoxines afin de modéliser l’infection et l’inflammation. L’avancement de notre compréhension des mécanismes de la réponse inflammatoire et du rôle central des eicosanoïdes a été facilité par des expériences récentes comparant divers macrophages primaires avec des lignées cellulaires, ainsi qu’au travers de l’analyse des flux de métabolites dans les macrophages et de leur analyse protéomique. L’analyse lipidomique de cellules complémentées avec de petites quantités d’acides gras Oméga-3 – acide eicosapentaénoïque (EPA) et acide docosahexaénoïque (DHA) – renseigne sur les effets généraux de l’EPA et du DHA sur les eicosanoïdes inflammatoires et leur mécanismes d’action. L’EPA et le DHA sont également essentiels dans la synthèse de très longues chaînes d’acides gras, qui joue un rôle central dans la fonction rétinienne.