Depuis 2014, les cours de Dominique Charpin portent sur des aspects très variés de la civilisation mésopotamienne, étudiée avant tout à partir des textes, en prenant en compte les données de l'archéologie. Certains cours ont porté sur les trois millénaires antérieurs à l'ère chrétienne, comme ceux consacrés aux temples ou à la conclusion des alliances. D'autres ont été plus spécifiquement dévolus à la période paléo-babylonienne (2000-1600 av. J.-C.) : ils ont éclairé la pratique de l'écrit (la correspondance), présenté une ville particulière (Ur), ou étudié une période précise (les successeurs de Hammu-rabi). Ces cours intègrent non seulement les données les plus récemment publiées, mais souvent également des inédits, ce qui permet de relire avec un œil neuf les témoignages connus antérieurement. Cet enseignement constitue le couronnement d'une recherche de longue durée et se prolonge par la publication de livres.

Les recherches menées dans le cadre de cette chaire portent sur la civilisation mésopotamienne durant les trois millénaires de son existence. Elles s'appuient sur les textes sumériens et akkadiens notés en écriture cunéiforme. Les travaux de Dominique Charpin et ceux de son équipe portent particulièrement sur l'époque paléo-babylonienne, à travers ses archives, découvertes tant en Irak qu'en Syrie : le site internet archibab.fr qu'il a créé et continue d'alimenter avec son équipe parisienne et une coopération internationale est devenu un outil incontournable pour les assyriologues qui veulent étudier cette documentation très abondante (plus de trente-quatre mille textes publiés à ce jour), variée (lettres, procès, contrats, notes comptables, etc.) et en constant accroissement (plus de trois cents textes nouveaux par an en moyenne). Les travaux de Dominique Charpin portent tant sur la Haute-Mésopotamie (notamment le site de Mari) que sur la Mésopotamie méridionale (en particulier Larsa et Ur, deux missions archéologiques en activité dont Dominique Charpin est épigraphiste).